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1943年11月30日、勅令第897号「台湾総督府官制中改正」によって行政機構の再編が行われると、食糧局は農商局に吸収され、食糧部として編入された。管掌事務は、食糧の配給と消費に関する事項と定められた。同年12月1日の「台湾総督府事務分掌規程改正」により、人事・予算・経理を担う庶務課、米穀の需給調整や配給統制を執り行う米穀課、米穀以外の食料品を対象とする食品課の三課が部内に置かれた。

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「御署名原本・昭和十八年・勅令第八九七号・行政機構整備実施ノ為ニスル台湾総督府官制中改正ノ件」（Ref. A03022879000）。「台湾総督府報」1943年12月1日（典蔵号0072030499a008）。