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主計課は、台湾総督府財務局の部署である。1897年10月13日の勅令第362号により、台湾総督府財務局が発足。同年11月1日、台湾総督府行政事務規程によって、財務局は税務・主計・経理・土木の4課体制とされた。主計課は予算決算及び会計監督に関する事務を分掌。1898年6月18日、勅令第106号により財務局は廃局、主計課は民政部の部局として再編された。

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御署名原本・明治三十年・勅令第三百六十二号・台湾総督府官制制定台湾総督府条例台湾総督府民政局官制台湾総督府軍務局官制及台湾総督府民政局土木部官制廃止（A03020310400）。「台湾総督府行政事務規程」（『官報』第4310号、1897年11月11日）。

峡謙齊・会計課長兼務（1902年5月1日現在）／阿部滂・会計課長兼務（1911年5月1日現在）／小林善八（1916年5月1日現在）／菊池武芳（1918年5月1日現在）