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農商務省水産局は、1885年2月に設置された。1890年6月には農務局に統合される形で廃止されたが、1897年6月に再び農務局から分割されて再設置され、水産に関する事務を所管した。水産局の下には漁務課と水産課が置かれ、漁業及び漁場、漁業組合、水産調査会に関する事項は漁務課、製塩業及び塩田、地方水産伝習所及び水産講習所、水産調査所に関する事項は水産課が所管した。水産局はその後統合・分割されることなく、1925年に新設の農林省の水産局に引き継がれた。

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Ref. A15113137200 「農商務省分課規程改定」（1897年6月14日）『官報』第4183号、1897年6月14日 吉川弘文館編集部編『近代史必携』（吉川弘文館、2007年）、204-9頁